Співвідношення шансів — це ймовірність отримання конкретного спостережуваного співвідношення узгодженості, поділена на ймовірність отримання цього співвідношення випадковим чином. [На вірогідність конкордації також впливають частоти алелів у локусі, які тут встановлені на константі θ = 0,8]. Потім, Оцінка LOD = журнал 10 (співвідношення шансів).
LOD також можна розрахувати на основі стандартного відхилення відгуку (Sy) кривої та нахилу калібрувальної кривої (S) на рівнях, що наближають LOD за формулою: LOD = 3,3 (Sy/S).
Статистична оцінка того, чи є два генетичні локуси достатньо фізично близькими один до одного (або «зчепленими») на конкретній хромосомі, щоб вони могли успадковуватися разом. Оцінка LOD 3 або вище зазвичай означає, що два гени розташовані близько один до одного в хромосомі.
Метод lod-score є найбільш поширений для проведення аналізу зв’язків і дозволив встановити зв’язок між деякими спадковими видами раку та пов’язаними з раком генами. Основні приклади включають сімейну ретинобластому (RB), спадковий колоректальний рак, NF1 і сімейний рак молочної залози.
Оцінка lod – це логарифм відношення ймовірності спостереження певного набору сімейних даних за конкретною альтернативною гіпотезою зв’язку відносно нульової гіпотези про відсутність зв’язку між хворобою та маркерні локуси (H0: θ=½).
Співвідношення шансів — це ймовірність отримання конкретного спостережуваного співвідношення узгодженості, поділена на ймовірність отримання цього співвідношення випадковим чином. [На вірогідність конкордації також впливають частоти алелів у локусі, які тут встановлені на константі θ = 0,8]. Потім, Оцінка LOD = log 10 (співвідношення шансів).
