Топоізомерази II типу діють шляхом генеруючи тимчасовий розрив дволанцюгової ДНК, після чого відбувається подія дволанцюгового пасажу ДНК [14–16,19]. Отже, ці ферменти здатні видаляти суперспіральні закрутки з ДНК і розділяти зв’язані або заплутані дуплексні молекули.
Топоізомераза II відіграє ряд важливих ролей в еукаріотичних клітинах і бере участь практично в усіх основних процесах, які включають генетичний матеріал. Це роз'єднує дочірні хромосоми, які переплутані після реплікації, і розв'язує вузли ДНК, які утворюються під час рекомбінації.
Топоізомераза 1 створює крихітний розріз в одному ланцюзі ДНК, щоб другий ланцюг розкрутився, а потім лігує цей розрив у ланцюзі. Цей фермент не потребує АТФ. Топоізомераза 2 розщеплює обидва ланцюги ДНК, щоб дозволити новосинтезованому ланцюгу пройти крізь них, щоб уникнути заплутувань.
Топоізомерази II і IV є хорошими антибактеріальними мішенями з кількох причин: (1) вони є білками, необхідними для життєздатності бактерій, які беруть участь у реплікації бактеріальної ДНК і поділі клітин, (2) вони є основними компонентами всіх бактерій, (3) пригнічення їх функції в бактеріях зазвичай призводить до бактерицидної дії (…
ДНК-топоізомерази — це всюдисущі ферменти, які зустрічаються у всіх типах клітин від вірусів до людини. Ці ферменти регулюють суперскручування ДНК каталізує намотування та розкручування ланцюгів ДНК.
Разом ці дані вказують на те, що топоізомераза II зазвичай гідролізує один АТФ перед транспортуванням Т-сегмента ДНК через тимчасовий розрив у G-сегменті. Хоча для транспортування ДНК абсолютно необхідне лише зв’язування АТФ, гідроліз одного АТФ явно прискорює швидкість транспорту.
